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已有 23520 次阅读 2017-5-21 21:17 |个人分类:科学感想|系统分类:科普集锦

     由于一般的遗传学课本上没有引入共线基因或同线基因（syntenic genes）这个概念，因此，往往对连锁基因（linked genes）也没有足够的阐述。

     共线基因或同线基因是指位于同一条染色体上的基因（syntenic genes genes that are located on the same chromosome）

     连锁基因是指同一条染色体上的两个基因位置足够近，因此并不表现独立遗传的基因（when two genes are so close to one another that their alleles can't assort independently）

     连锁基因（linked genes）总是共线基因或同线基因（syntenic genes），但共线基因或同线基因并不一定是连锁基因，如果两个共线基因或同线基因在染色体上的距离足够远，其等位基因（在减数分裂过程中）表现独立分配时（重组率达到50%），就不是连锁基因（Linked genes are always syntenic, and they are always located near or one another on a chromosome. When syntenic genes are so far apart on the chromosome that crossing over between them generates independent assortment of the alleles, the genes are not linked.）

In classical genetics, synteny describes the physical co-localization of genetic loci on the same chromosome within an individual or species. Today, however, biologists usually refer to synteny as the conservation of blocks of order within two sets of chromosomes that are being compared with each other. This concept can also be referred to as shared synteny.

The classical concept is related to genetic linkage: Linkage between two loci is established by the observation of lower-than-expected recombination frequencies between them. In contrast, any loci on the same chromosome are by definition syntenic, even if their recombination frequency cannot be distinguished from unlinked loci by practical experiments. Thus, in theory, all linked loci are syntenic, but not all syntenic loci are necessarily linked. Similarly, in genomics, the genetic loci on a chromosome are syntenic regardless of whether this relationship can be established by experimental methods such as DNA sequencing/assembly, genome walking, physical localization or hap-mapping.

Students of genetics employ the term synteny to describe the situation in which two genetic loci have been assigned to the same chromosome but still may be separated by a large enough distance in map units that genetic linkage has not been demonstrated.

https://en.wikipedia.org/wiki/Synteny

Genes or loci can be linked either physically or genetically. Genes that are physically linked are on the same chromosome and are thus syntenic. Only syntenic genes can be genetically linked. Genes that are linked genetically are physically close enough to one another that they do not segregate independently during meiosis.

http://medicine.jrank.org/pages/2476/Linkage-Recombination-Basic-Concepts.html

In addition, if two genes are on the same chromosome and are far enough apart that they undergo recombination at least 50% of the time, the genes are independently assorting and do not show linkage. Genes independently assort at a distance of 50 cM or more apart. This means that no statistical test would allow researchers to measure linkage.

Finally, linked genes that do not independently assort show statistical linkage. Statistical linkage is detected as deviation from independent assortment that favors the parental gametes. Syntenic genes are genes that are physically located on the same chromosome, whether or not the genes themselves exhibit linkage (Passarge et al., 1999). Therefore, all linked genes are syntenic, but not all syntenic genes show genetic linkage.

https://www.nature.com/scitable/topicpage/thomas-hunt-morgan-genetic-recombination-and-gene-496