《肿瘤二代测序临床报告解读共识》四大亮点引关注

近年来，新型治疗药物研发的快速发展以及临床多学科综合治疗模式的不断优化，让二代基因测序（简称“NGS”）成为肿瘤医生常用的检测工具。因而，如何将通过NGS检测发现的肿瘤基因组变异信息，及时、准确地转化为临床医生可读取并可用于指导临床决策的信息，正变得越来越重要。

2022年4月8日，广东省人民医院张绪超教授在《肿瘤二代测序临床报告解读共识》暨第二次NGS全国调研项目启动会上表示，中国临床肿瘤学会（CSCO）肿瘤生物标志物专家委员会组织撰写的《肿瘤二代测序临床报告解读共识》（以下简称“共识”），是中国首个针对NGS报告解读规范化的共识性文件，将于2022年4月底在《循证医学》杂志正式发布。

据了解，“共识”呈现出以下四大核心亮点：

亮点一：《指引》升级为《共识》，临床规范性更强

相比于传统检测，NGS检测数据量大、报告信息庞杂，对临床医生NGS报告解读形成了阻碍。2019年，CSCO肿瘤生物标志物专家委员会发布了中国首个NGS临床应用调研。调研显示，NGS已成为中国临床肿瘤医生常用检测工具，但中国超90%临床医生需要NGS报告解读支持。

在此背景下，CSCO肿瘤生物标志物专家委员会携手临床分子病理学、分子生物学和生物信息学等多个领域的80余位专家组成NGS报告解读专家组编撰并发布了《指引》，首次为临床医生提供了NGS报告解读策略。2022年，CSCO肿瘤生物标志物专家委员会携手150余位各学科专家，再次对《指引》进行迭代升级，旨在进一步规范NGS报告解读方法，提升临床专家报告解读能力，为患者带来更多的临床获益。

亮点二：贴近临床实战，理论与实践融合

《共识》从临床靶点或驱动基因相关体细胞变异注释及解读、NGS报告解读及临床决策和可报告范围及质量控制三个方面对NGS临床报告解读作以规范，并将典型的临床案例与国际指南、最新临床研究相结合，有效辅助临床医生在短时间内进行快速准确的判断，进而提高治疗效率与效果。

针对临床医生最为关注的NGS报告解读及临床决策，《共识》创新性地提供了决策树，帮助临床专家理解单个驱动基因以及多个驱动基因变异的差异，以及在临床不同的场景下的解决方案，准确地把这些关键性信息应用于临床。

同时，《共识》还明确了一些重要的计算方法，如血液检测中肿瘤相关的靶点基因突变丰度、拷贝数如何计算等。通过这些计算方法，助力临床医生更好地选择与应用临床药物。

亮点三：增加基因融合、外显子跳读突变检测解读

随着靶向药物的不断上市以及NGS检测技术不断进步，仅仅使用DNA检测已经无法满足所有的临床需求。纪念斯隆凯特琳癌症中心（MSKCC）大型回顾性数据表明，现有DNA测序检测为全阴性的患者中依旧有约14.2%的患者有重要的可用药靶点。

为了让更多患者从精准诊疗中获益，《共识》增加了RNA测序的推荐，并纳入了融合变异、外显子跳读等变异形式的临床解读，对复杂变异形式提供解读指导，助力临床精准诊疗。

亮点四：增加了HRD及实体瘤MRD相关解读内容

《共识》体现出专业性与前沿性并存的特征，在对国内外NGS检测热点进行认真分析、讨论和总结后，纳入了实体瘤微小残留病灶（minimal residual disease/molecular residual disease/measurable residual disease，MRD）及同源重组缺陷（homologous recombination deficiency，HRD）相关内容，为临床诊疗提供了新的参考依据和指导方法。

近年来，肿瘤基因组标签在肿瘤精准诊疗中的作用日益凸显。《共识》在详细解读肿瘤突变负荷（tumor mutational burden，TMB）及微卫星不稳定性（microsatellite instability，MSI）这两个重要免疫治疗相关标志物标签的基础上，增加了TMB一致性检测的说明，助力临床规范解读TMB。

同时，《共识》还新增了HRD检测相关内容。HRD作为PARP抑制剂重要的疗效预测标志物在患者管理中发挥越来越重要的作用。《共识》介绍了HRD解读的要点，并引入了以美国食品和药物管理局（FDA）批准的HRD检测方法Myriad myChoice® CDx[1-2]。该方法通过BRCA 1/2的致病性变异状态及基因组不稳定评分（genomic instability score，GIS）评价HRD状态，报告解读已有较明确的标准。

值得一提的是，Myriad myChoice® CDx这一FDA批准的专利算法已由燃石医学独家引入并商业化。2021年11月，燃石医学myChoice™ HRD Plus已正式在中国上市，为临床使用PARP抑制剂治疗提供权威、可靠的指导，让更多的中国肿瘤患者从PARP抑制剂的治疗中获益。

精准检测是精准医学的前提， NGS报告的分析和解读是其中具有决定性影响的关键环节，但目前中国NGS报告解读规范化任重道远。广东省人民医院吴一龙教授认为，《共识》的发布，将为NGS报告解读提供标准，让临床医生、患者得到更规范、更准确的NGS检测结果，同时《共识》的发布也为国家制定NGS行业的相关标准提供了重要的参考。