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2024-07-17 13:53| 来源: 网络整理| 查看: 265

[转载] 【VASP实用脚本】 Material Studio一键获取POSCAR(可固定原子)的方法

已有 12430 次阅读 2019-9-27 17:45 |个人分类:第一性原理(vasp)|系统分类:科研笔记|文章来源:转载

脚本:xsd2pos.pl 

下载:xsd2pos.pl

语言:Perl

功能:将Material Studio中建立的后缀名为xsd的文件直接转换为可供VASP使用的POSCAR

作者:武汉理工大学赵焱课题组

使用方法:

Material Studio中建模,需要固定的原子也固定好;我使用一个非常常见的Anantase TiO2的(001)表面上,吸附一个CO分子为例。(具体如何切面,如何固定原子,在这就不赘述了,有很多教程)

fig1.jpg

将xsd2pos.pl脚本拖拽到你想要转换的xsd文件的文件夹下。

fig2.jpg

改名,在脚本中把要转换的结构文件的名字改过来;

fig3.jpg

运行脚本;

Fig4.jpg

如果你在工具栏没找到这个按钮,就把它在View里面选择上;

Fig5.jpg

最终的效果如下:

Fig6.jpg

最后留个小问题:为什么用perl脚本,这个脚本又是怎么判断这个原子是否固定,并在后面标注F和T的呢?有兴趣的同学可以想一想。

FIg7.jpg

转载改编自:http://www.cailiaoniu.com/159458.html

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