如何绘制漂亮的通路示意图？

平时，我们做KEGG富集分析得到的Pathway maps往往都非常丑，而且还是非常小且非常模糊的位图，无法直接用到文章中。而我最近在文献中看到的一个代谢通路图，就非常好看，如下。

那么，这么好看的通路图如何绘制呢？仔细观察可以发现，图中只是绘制了细胞膜和线粒体，主体部分是箭头和文字，很容易绘制。下面我就借这个案例，分享一下如何用Ai（Adobe illustrator）绘制这类通路示意图。

绘制线粒体

 先创建画板，宽约20cm，然后绘制草图，大致确定图形元件的大小和位置，只需用简单的图形和线条表示即可。

然后开始绘制线粒体，先绘制3个叠放的椭圆，使用不同亮度的橙黄色使所绘线粒体更具有立体感。

选中上层的椭圆，使用橡皮工具“擦”出线粒体的内膜皱褶，如下。

使用变形工具和钢笔工具箱中的锚点工具调整转角弧度，将变形工具的简化值调大一些，让转角更加圆滑一些，效果如下。

绘制好的线粒体如下：

绘制细胞膜

 接下来，分别使用椭圆工具、矩形工具和曲率工具绘制膜蛋白的小亚基，如下，使用直接选择工具（小白工具）和锚点工具可调整矩形边的弯曲程度，使用曲率工具可绘制不规则的图形。

使用渐变工具为图形添加线性渐变，具体的渐变设置方法如下。

选中哑铃状的亚基图形，通过对象菜单中的扩展命令，对图形的填充颜色和描边进行分离。拓展图形后，右键，然后取消编组。

接着选中右侧“亚基”的中间区域（填充色部分），使用网格工具为图形添加高光，如下，点击高光处（交叉点）的锚点可设置高光颜色。

接下来，选中右侧的亚基图形，双击镜像工具再复制一个，注意这里的对称轴选择“垂直”。然后调整图形之间的叠放次序和位置，满意后“Ctrl+G”组合图形。

使用选择工具（小黑工具）选中一个膜蛋白后，按住“Alt”键拖动，可快速复制出一个膜蛋白。选中这个膜蛋白后，点“重新着色图稿”按钮，可快速调整图形的配色，如下。

接着绘制细胞膜。首先，绘制单个磷脂分子，使用直线段工具绘制疏水结构，选中直线后，通过效果/扭曲和变换/波纹效果实现弯曲效果，当然，你也可以使用铅笔工具直接绘制波浪曲线。

在波纹效果窗口，可通过修改参数设置波纹的外形，具体如下，修改完成后，再复制一条曲线出来。

然后选中整个磷脂分子，双击镜像工具进行水平对称复制，具体参数如下。

接着选中两个磷脂分子，“Ctrl+G”编组，按住“Alt”键拖动，可快速复制出一个，然后使用快捷键“Ctrl+D”（重复上一操作）快速复制出更多的磷脂分子，如下。将画好的2个膜蛋白置于磷脂双分子层上，细胞膜就完成了。

添加箭头和文字

 使用椭圆工具和直线段工具绘制箭头，使用剪刀工具“剪断”线条，实现圆弧曲线的绘制，如下。

选中线条后，点击“描边”，可设置虚线效果和添加箭头，通过缩放参数，修改箭头的大小。

使用圆角矩形工具，绘制文本标签的文本框，如下。

最后，使用文字工具加上文本标签，点击快速调整栏中的“字符”，如下，可设置字体的样式和大小，还可以设置上下标。

最终的绘制效果如下：

好啦，今天就分享到这里啦，更多Ai相关的课程可以到OmicShare观看视频教程。

视频链接：

https://www.omicshare.com/class/home/index/series?id=79

▼参考文献▼

Encarnación-Rosado, Joel, and Alec C. Kimmelman. "Harnessing metabolic dependencies in pancreatic cancers." Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology (2021): 1-11.