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R语言:利用survminer包实现生存分析及可视化
总述下载和安装单一组别生存曲线的绘制两组生存曲线的绘制基本方法改变文字大小,字体和颜色只改变字号同时改变文字大小,字体和颜色
改变图例位置,图例标题和图例名称改变曲线类型和颜色添加风险表扩大x轴的坐标范围Transform survival curves累积发病率图危险率函数Arbitrary function
多组生存曲线的绘制
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总述
survminer包是生物信息学中实现生存分析曲线绘制最常用的包,包含函数ggsurvplot(),还可使用ggplot2. ggsurvplot() 轻松绘制美观并且格式工整的生存曲线。同时还能给出p值,风险值等参数。 下载和安装 install.packages("survminer")或者,也可以选择从GitHub上安装 if(!require(devtools)) install.packages("devtools") devtools::install_github("kassambara/survminer")加载安装好的包 library("survminer") 单一组别生存曲线的绘制 #调用生存曲线中另一常用的survival包 require("survival") #survival包自带肺癌数据集:lung,查看数据样式 head(lung) #survival包中的Sruv函数可以创建一个生存对象 fit |
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