Bigwig 可视化用 tackPlotR 试试看? 您所在的位置:网站首页 IGV图怎么看track Bigwig 可视化用 tackPlotR 试试看?

Bigwig 可视化用 tackPlotR 试试看?

2024-07-10 15:44| 来源: 网络整理| 查看: 265

你在鼓楼的夜色中

4e02164b360f257c0f832f434e74b5ea.gif

1引言

写了一个小 R 包 tackPlotR, 用来可视化 bigwig 的,感觉大家需求还挺大的。

地址:

https://github.com/junjunlab/tackPlotR

参考文档:

https://github.com/junjunlab/tackPlotR/wiki

d7cf882bd5d444f0aa67ee74286bcb92.png 2安装 devtools::install_github('junjunlab/tackPlotR') # help ?loadBWfile ?plotTrack 3使用介绍

主要分为两步, 读取 bigwig 文件 及 绘图。

读取文件

具体怎么分组看你自己:

library(tackPlotR) library(ggsci) library(rtracklayer) # 1.load gtf gtf %   data.frame() # help ?loadBWfile file 


【本文地址】

公司简介

联系我们

今日新闻

    推荐新闻

    专题文章
      CopyRight 2018-2019 实验室设备网 版权所有